Die Geschichte der Muncie Flyers geht auf den Congerville Athletic Club zurück. Dieser stellte seit 1905 jeweils ein Team für die lokale Football-Meisterschaft der Stadt Muncie in Zentral-Indiana. Das Teams schlug sich dabei in aller Regel gut: 1910 etwa gewann es die Meisterschaft mit zehn Siegen bei einem Untentschieden und ohne einen einzigen Punkt zugelassen zu haben. 1916 machte sich das Football-Team als Muncie Thirds selbständig, ein Jahr später benannte man sich in Muncie Flyers um. 1917 übernahm schliesslich Earl Ball, ein lokaler Unternehmer, das Team als Besitzer.

Earl Ball enagierte ehemalige College-Stars wie etwa Al Feeney von der Notre Dame University oder Dick Abrel von der Purdue University, die aber in der Regel schnell wieder zu anderen Mannschaften wechselten. Nachdem das Team wegen der Spanischen Grippe 1918 den Spielbetrieb einstellen musste, stiess dann auf die Saison 1919 Quarterback Severin «Cooney» Checkaye zum Team. Earl Ball machte ihn später zum Co-Besitzer des Teams und gemeinsam nahm man 1920 auch an der Gründungsversammlung der American Professional Football Association (APFA) in Canton teil.

Doch auch wenn die Muncie Flyers zu den zehn Gründerteams der heutigen NFL gehörten, so sind gleichzeitig auch eines der erfolglosesten Teams der Ligageschichte überhaupt. In zwei Saisons spielten die Flyers nur gerade drei Partien, verloren alle drei und brachten dabei keinen einzigen Punkt zustande. Nach der Saison 1921 schied Earl Ball als Besitzer aus und Cooney Checkaye entschied sich dafür, der NFL den Rücken zu kehren. Er benannte das Team wieder in Congerville Flyers um und spielte vor allem gegen andere unabhängige halbprofessionelle Teams und dies mit einigem Erfolg. 1926 stellten die Flyers dann den Spielbetrieb gänzlich ein.

Jahr	Resultat	Klassierung	Erfolg	Coach
1920	0-1	14.		Ken Huffine
1921	0-2	18.		Cooney Checkaye

Anmerkung: Der Helm gibt die Teamfarben wieder und wurde in dieser Form so nie getragen.